28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0012 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0012  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.55477 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  92.59 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0014  tRNA-Val  90.54 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190864  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0034  tRNA-Val  89.04 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0020  tRNA-Val  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0023  tRNA-Val  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.494525  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0005  tRNA-Val  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0804752  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0012  tRNA-Val  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.423329  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0014  tRNA-Val  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0009  tRNA-Val  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.31533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0042  tRNA-Val  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123264  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0011  tRNA-Val  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.592094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0006  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.642038 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0015  tRNA-Val  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0118256  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0048  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.397818  normal  0.996159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0005  tRNA-Val  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0005  tRNA-Val  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.826199  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0005  tRNA-Val  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0004  tRNA-Val  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0051  tRNA-Val  85.48 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000288516  hitchhiker  0.0000067546 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0310  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0026  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0120  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0065  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337548 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0041  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000102386  normal  0.397694 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0021  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.304256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22668  hitchhiker  0.0000658151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>