46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_R0012 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_R0012  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.423329  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0014  tRNA-Val  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0042  tRNA-Val  98.55 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123264  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0009  tRNA-Val  98.55 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.31533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0005  tRNA-Val  98.55 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0804752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0011  tRNA-Val  90.62 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.592094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0048  tRNA-Val  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000458542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0046  tRNA-Val  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000479411  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0012  tRNA-Val  91.11 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.55477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0015  tRNA-Val  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.527098  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0052  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137415  normal  0.324257 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  94.12 
 
 		 378 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0034  tRNA-Val  87.93 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0044  tRNA-Ala  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R10  tRNA-Val  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-1  tRNA-Val  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00200335  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt21  tRNA-Val  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  94.12 
 
 		 367 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt21  tRNA-Val  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0023  tRNA-Val  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000500863  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0025  tRNA-Val  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13870  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0328341  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13850  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15127  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0005  tRNA-Val  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0005  tRNA-Val  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0005  tRNA-Val  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.826199  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0004  tRNA-Val  93.94 
 
 		 72 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0056  tRNA-Val  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000959605  hitchhiker  0.0000412261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0059  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00221278  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0014  tRNA-Val  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0057  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00234927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0058  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00230233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0053  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000895644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0079  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.556141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0078  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0389379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0075  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.29937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>