More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_R0052 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_R0052  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137415  normal  0.324257 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0039  tRNA-Val  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0041  tRNA-Val  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0040  tRNA-Val  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000943403  normal  0.0843805 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0011  tRNA-Val  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0048  tRNA-Val  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000458542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0046  tRNA-Val  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000479411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0004  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000770056 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0023  tRNA-Val  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000500863  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0025  tRNA-Val  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0042  tRNA-Val  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-1  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00200335  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  94.64 
 
 		 378 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt21  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  94.64 
 
 		 367 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt21  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0005  tRNA-Val  94.64 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.826199  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0005  tRNA-Val  94.64 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0005  tRNA-Val  94.64 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0038  tRNA-Val  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0349926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0057  tRNA-Val  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00234927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0058  tRNA-Val  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00230233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0059  tRNA-Val  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00221278  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0035  tRNA-Val  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0004  tRNA-Val  94.34 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0078  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0323517  normal  0.156199 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0079  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.101536  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0077  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.035914  normal  0.156814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0082  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.278662  normal  0.0519347 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0042  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279186  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0081  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.277615  normal  0.0524601 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0080  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273364  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0044  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266715 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0045  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0252567  normal  0.0396614 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0083  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.380534  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R10  tRNA-Val  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0018  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.209747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0011  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000637042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0006  tRNA-Val  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0027  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0022  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2440  tRNA-Val  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2943  tRNA-Val  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2946  tRNA-Val  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.411322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2949  tRNA-Val  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116038  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2150  tRNA-Val  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2626  tRNA-Val  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.888803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2629  tRNA-Val  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.8453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2632  tRNA-Val  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.602317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0040  tRNA-Val  87.84 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00170097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0028  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.337243 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3089t  tRNA-Val  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0026  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00167202  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0066  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000106688  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0092  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000905029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0039  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000106718  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3218  tRNA-Val  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.229381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3219  tRNA-Val  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232653  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3220  tRNA-Val  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0584974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3221  tRNA-Val  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0555277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3222  tRNA-Val  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.055188  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3223  tRNA-Val  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0588431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0029  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.342231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0036  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000113346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0061  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00024378  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0123  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000761032  normal  0.999094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0122  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000703597  normal  0.991143 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3188t  tRNA-Val  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0373931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0030  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000589005  normal  0.351876 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1117t  tRNA-Val  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00968485  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0065  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000940035  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0032  tRNA-Val  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000419269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0032  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000487693  normal  0.350378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0116  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000516317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0031  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000509299  normal  0.347644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0033  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000154108  normal  0.350378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0034  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000784133  normal  0.347644 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3082t  tRNA-Val  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0006696  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0070  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000218766  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0060  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000229541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0063  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000284788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0064  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000300215  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0062  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0027  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000568482  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0083  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131084  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0069  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0068  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000103531  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0067  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000378114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0103  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000279802  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0035  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0037  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000120415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0034  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000134518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0117  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000194506  normal  0.999094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0115  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0119  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000206834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0118  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00020053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0121  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000223353  normal  0.991143 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0120  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0078  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000285873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0038  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>