More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_R0059 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_R0057  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00234927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0058  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00230233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0059  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00221278  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0023  tRNA-Val  98.33 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000500863  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0025  tRNA-Val  98.33 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0077  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.035914  normal  0.156814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0078  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0323517  normal  0.156199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3218  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.229381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3219  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232653  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3220  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0584974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3221  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0555277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3222  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.055188  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3223  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0588431  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0081  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.277615  normal  0.0524601 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0082  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.278662  normal  0.0519347 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0080  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273364  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0083  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.380534  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0079  tRNA-Val  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.101536  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0086  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0087  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0083  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000495241  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0085  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000375389  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0080  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000267941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0088  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000718158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0106  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000011333  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0105  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000937132  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0089  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000619858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0096  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000340582  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0097  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000319482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0098  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000887403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0079  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000283513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0094  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000297438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0093  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000828011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0081  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000114332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0082  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000470368  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0088  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000319875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0089  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000342234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0090  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0091  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288629  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0092  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000281148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0093  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0095  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000338058  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0098  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0099  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0100  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000389381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0101  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000312411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0102  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000271468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0084  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000842373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0107  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000125343  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0104  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000459096  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t035  tRNA-Val  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00018344  normal  0.230227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t034  tRNA-Val  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  normal  0.228577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t037  tRNA-Val  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000163594  normal  0.236842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t033  tRNA-Val  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112794  normal  0.228577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t036  tRNA-Val  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000159787  normal  0.229445 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t038  tRNA-Val  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000157336  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0059  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000138631  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t075  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t077  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0016  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0037  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000442416  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0061  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000239094  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0061  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000062426  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0026  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000755245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0008  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138827  hitchhiker  0.000689808 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0110  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0035  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0016  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113655  normal  0.435414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0039  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000106718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0067  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000378114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0083  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0037  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000120415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0117  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000194506  normal  0.999094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0036  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000113346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0068  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000103531  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t074  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t076  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0063  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000284788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0066  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000106688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0116  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000516317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0061  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00024378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0038  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0078  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000285873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0121  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000223353  normal  0.991143 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0059  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000131386  normal  0.0398666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0060  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140872  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0056  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000122931  normal  0.695646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0057  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000113368  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0058  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000101774  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0059  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000125159  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0060  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000118562  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0115  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0103  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000279802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0123  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000761032  normal  0.999094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0062  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0092  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000905029  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0054  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000293035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0055  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0056  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000283847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0057  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>