More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_R0106 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_R0095  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000338058  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0097  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000319482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0096  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000340582  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0094  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000297438  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0104  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000459096  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0105  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000937132  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0084  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000842373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0088  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000718158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0087  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0086  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0089  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000619858  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0085  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000375389  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0082  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0081  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000114332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0083  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000495241  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0093  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000828011  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0088  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000319875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0089  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000342234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0090  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0091  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288629  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0092  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000281148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0093  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0079  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000283513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0098  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000887403  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0106  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000011333  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0107  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000125343  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0098  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0099  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0100  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000389381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0101  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000312411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0102  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000271468  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0080  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000267941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t037  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000163594  normal  0.236842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t036  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000159787  normal  0.229445 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t038  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000157336  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t033  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112794  normal  0.228577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t034  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  normal  0.228577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t035  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00018344  normal  0.230227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t075  tRNA-Val  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t077  tRNA-Val  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0061  tRNA-Val  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000239094  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0061  tRNA-Val  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000062426  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0059  tRNA-Val  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000138631  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0115  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107203  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0116  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000516317  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0119  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000206834  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0117  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000194506  normal  0.999094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0118  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00020053  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0062  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0066  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000106688  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0070  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000218766  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0121  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000223353  normal  0.991143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t074  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t076  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0034  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000134518  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0036  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000113346  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0035  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119187  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0083  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0122  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000703597  normal  0.991143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0037  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000120415  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0026  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00167202  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0027  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000568482  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0028  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.337243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0029  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.342231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0030  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000589005  normal  0.351876 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0031  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000509299  normal  0.347644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0032  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000487693  normal  0.350378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0033  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000154108  normal  0.350378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0034  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000784133  normal  0.347644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0056  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805133  normal  0.0381959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0057  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000143405  normal  0.0390481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0058  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000142133  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0060  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140872  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0056  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000122931  normal  0.695646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0057  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000113368  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0058  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000101774  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0059  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000125159  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0060  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000118562  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0103  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000279802  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0078  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000285873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0039  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000106718  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0038  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124113  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0123  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000761032  normal  0.999094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0061  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00024378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0060  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000229541  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0054  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000293035  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0055  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302516  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0056  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000283847  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0057  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258205  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0058  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000107196  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0008  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138827  hitchhiker  0.000689808 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0016  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113655  normal  0.435414 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0026  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000755245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0110  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00758879  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0064  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000300215  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0063  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000284788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0067  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000378114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0065  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000940035  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0069  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0068  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000103531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>