21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0014 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0014  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190864  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0034  tRNA-Val  94.34 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0012  tRNA-Val  90.54 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.55477 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0023  tRNA-Val  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.494525  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0006  tRNA-Val  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.642038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0058  tRNA-Val  88 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.729996  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0007  tRNA-Val  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.997885  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0012  tRNA-Val  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.423329  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0042  tRNA-Val  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123264  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0009  tRNA-Val  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.31533 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0014  tRNA-Val  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0005  tRNA-Val  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0804752  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0008  tRNA-Val  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0009  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0051  tRNA-Val  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0015  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0118256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0034  tRNA-Val  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0003  tRNA-Val  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.892516 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0062  tRNA-Val  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.268364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0011  tRNA-Val  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.592094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>