More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13870 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13870  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0328341  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13850  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15127  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14880  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.67591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0041  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00225081  hitchhiker  0.00893878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00820  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0025  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0028  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0027  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0024  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0020  tRNA-Gly  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.748277  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0017  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0016  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0020  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0016  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0044  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.363029  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0023  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14032  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635466  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  94.92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_002950  PGt52  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.894326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0020  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0370755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  94.92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt13  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  94.83 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  94.83 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0044  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0030  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.949904  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0064  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173961  normal  0.106433 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0038  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499148  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07190  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.886703 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0024  tRNA-Gly  96 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474961  hitchhiker  0.000422709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0026  tRNA-Gly  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390133  normal  0.0221224 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0028  tRNA-Gly  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000469989  normal  0.0212427 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11980  tRNA-Gly  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000114191  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11950  tRNA-Gly  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000172827  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0053  tRNA-Gly  91.38 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000895644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0046  tRNA-Gly  94 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0004  tRNA-Gly  94 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0612672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0034  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0037  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0032  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000809268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0035  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15490  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt36  tRNA-Gly  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt36  tRNA-Gly  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15520  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0031  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0018  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0071  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00174778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0281  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000381106  hitchhiker  0.0000254958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0058  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0057  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>