299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0032 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0038  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0062  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167826  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0048  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0041  tRNA-Gly  97.06 
 
 		 75 bp  119  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000613233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0043  tRNA-Gly  97.06 
 
 		 75 bp  119  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000854209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0070  tRNA-Gly  97.06 
 
 		 75 bp  119  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0071  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00174778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0018  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0031  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0053  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000895644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309288  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0313014 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309363  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0002  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.231907  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0002  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0064  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.729531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0044  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0060  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.481193  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0281  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000381106  hitchhiker  0.0000254958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0075  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.29937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0079  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.556141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0078  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0389379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0050  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0051  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0024  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474961  hitchhiker  0.000422709 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0020  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0370755  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309120  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.15103  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309187  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309069  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt52  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.894326 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0059  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336039  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0062  tRNA-Gly  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.588176  normal  0.0646028 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0030  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0026  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.672407  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0044  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110849  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0085  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000120136  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlyVIMSS1309145  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1578  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1613  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.610826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0026  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0170  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0068  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00365529  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt13  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0064  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173961  normal  0.106433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0046  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0004  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0030  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.949904  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13850  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0020  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.748277  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1789  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0051  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>