More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11950 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11980  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000114191  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11950  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000172827  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07190  tRNA-Gly  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.886703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0026  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390133  normal  0.0221224 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0028  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000469989  normal  0.0212427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0068  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00365529  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0050  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0020  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0370755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0078  tRNA-Gly  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  91.04 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  91.04 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0028  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000877648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0177  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0034  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0037  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0025  tRNA-Gly  91.8 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0028  tRNA-Gly  91.8 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0035  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0032  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000809268 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0027  tRNA-Gly  91.8 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0024  tRNA-Gly  91.8 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0041  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13850  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0056  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15520  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15490  tRNA-Gly  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  91.04 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0018  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  91.04 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0909  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0042  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443767  normal  0.830121 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13870  tRNA-Gly  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0328341  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0006  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000670589  normal  0.608185 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0007  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264887  normal  0.61678 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1013  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  97.62 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  97.62 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  97.62 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  97.62 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14880  tRNA-Gly  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.67591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  97.62 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0612672  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0020  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0041  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00225081  hitchhiker  0.00893878 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00820  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0006  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0023  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506131  normal  0.313927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0038  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0044  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0005  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000151844  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0062  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.588176  normal  0.0646028 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0006  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0281  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000381106  hitchhiker  0.0000254958 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0031  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0020  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.748277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA4  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0021  tRNA-Gly  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0839387  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0050  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly03  tRNA-Gly  88.06 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.122122  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0012  tRNA-Gly  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0028  tRNA-Gly  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>