More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0026 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0051  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0060  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.481193  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0053  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000895644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0028  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0025  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0024  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0038  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499148  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0027  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0048  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0018  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13850  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0019  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0031  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0020  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.748277  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0062  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0071  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00174778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13870  tRNA-Gly  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0328341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14032  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0023  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0044  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.363029  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0017  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14880  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.67591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0016  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0020  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0016  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0041  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00225081  hitchhiker  0.00893878 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00820  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0002  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.367155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0038  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0025  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42192  normal  0.527647 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0034  tRNA-Trp  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0044  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0024  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0064  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.729531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_002950  PGt18  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt52  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.894326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0003  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.774544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>