232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_R0060 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.481193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 75 bp  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0031  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0053  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000895644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0051  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0018  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0071  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00174778  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0038  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0062  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167826  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0048  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0002  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0020  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0001  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0062  tRNA-Gly  87.88 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.588176  normal  0.0646028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0075  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.29937  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0079  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.556141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0078  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0389379  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0041  tRNA-Gly  86.36 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000613233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0043  tRNA-Gly  86.36 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000854209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0070  tRNA-Gly  86.36 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  86.36 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  86.36 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0537  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.26138e-32 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4999  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5683  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0251422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5692  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000815905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5728  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000760665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  100 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000299273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  100 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000174679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  100 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00746864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  100 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  100 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.34208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4765  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000105314  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-9  tRNA-Gly  100 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0690974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  100 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000170652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  100 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000219047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  100 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000594127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000064552  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0022  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5730  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5718  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0139  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00889637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0102  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000562923  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0281  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000381106  hitchhiker  0.0000254958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4573  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.110089 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0135  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000405897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0783  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.7717399999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0099  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0612  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000121451  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0090  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5815  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000650347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0086  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5030  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000514384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0858  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5637  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0022  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00428299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>