More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0062 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0062  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.588176  normal  0.0646028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0041  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000613233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0043  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000854209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0070  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0052  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0052  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0051  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0065  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0050  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0064  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.729531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0071  tRNA-Gly  92.65 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00174778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0031  tRNA-Gly  92.65 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0018  tRNA-Gly  92.65 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.36527  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  92.42 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  92.42 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  92.42 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  92.42 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  92.42 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0006  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2331  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0152091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2245  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82132  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2253  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0005  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000151844  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1978  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0241  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2165  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0891  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  89.33 
 
 		 777 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.101452  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1730  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.873105  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1755  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0031  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0053  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000895644  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  90.62 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  90.62 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0042  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443767  normal  0.830121 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1545  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0006  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000670589  normal  0.608185 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0909  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0010  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.695097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0011  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.770603  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0007  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264887  normal  0.61678 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0739  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.158339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1013  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0028  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0030  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000189578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0035  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0213758  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0855  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0069  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.494624  hitchhiker  0.00109102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0037  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0254902  normal  0.171485 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0025  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0033  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0406258  normal  0.16961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0017  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000592681  hitchhiker  0.00000010486 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0065  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000604165  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0017  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1789  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0031  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0675454  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0028  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.167752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0038  tRNA-Gly  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0050  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0028  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000877648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0177  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00080  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000419569  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0044  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.35893e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0083  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.37865e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0085  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.68672e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4723  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.032e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4671  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.05705e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t38  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA57  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256598  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA59  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0609929  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0024  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000696404  hitchhiker  0.000000493359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0023  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000631988  hitchhiker  0.000000537949 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0022  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R50  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R61  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R63  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2337  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0125428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0022  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000631988  hitchhiker  0.000000512691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0055  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00145932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4238  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.1159899999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0012  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000103528  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0013  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000958382  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0014  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000460398  unclonable  0.00000183303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0051  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000228053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0031  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.623556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0045  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.0236363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>