244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_R0052 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_R0051  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0050  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0041  tRNA-Gly  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000613233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0043  tRNA-Gly  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000854209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0070  tRNA-Gly  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0062  tRNA-Gly  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.588176  normal  0.0646028 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0064  tRNA-Gly  92.86 
 
 
75 bp  99.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.729531  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0031  tRNA-Gly  92.65 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046959  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  92.42 
 
 
75 bp  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  92.42 
 
 
75 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  92.42 
 
 
75 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  92.42 
 
 
75 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  92.42 
 
 
75 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0028  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.433481  normal  0.466553 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0044  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0031  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000029648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0046  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.098729  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0053  tRNA-Gly  90.91 
 
 
75 bp  83.8  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000895644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0018  tRNA-Gly  89.71 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0071  tRNA-Gly  89.71 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00174778  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0048  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  89.55 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0062  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0038  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0065  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000604165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  89.39 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  92.45 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  92.45 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  92.45 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0002  tRNA-Gly  92.45 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.231907  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0002  tRNA-Gly  92.45 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0079  tRNA-Gly  92.45 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.556141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0075  tRNA-Gly  92.45 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.29937  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0078  tRNA-Gly  92.45 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0389379  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309363  tRNA-Gly  92.45 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  92.45 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  92.45 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  92.45 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  92.45 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  92.45 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  92.45 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309288  tRNA-Gly  92.45 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0313014 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0016  tRNA-Gly  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0026  tRNA-Gly  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0241  tRNA-Gly  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0065  tRNA-Gly  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.109951  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0004  tRNA-Gly  86.76 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.679327 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.36527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  91.49 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  91.49 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  91.49 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  91.49 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  91.49 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  91.49 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  91.49 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  91.49 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  91.49 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  91.49 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  91.49 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1789  tRNA-Gly  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212776  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0017  tRNA-Ala  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476615  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0026  tRNA-Gly  88.68 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.672407  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0044  tRNA-Gly  88.68 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110849  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309069  tRNA-Gly  88.68 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309120  tRNA-Gly  88.68 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.15103  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309187  tRNA-Gly  88.68 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlyVIMSS1309145  tRNA-Gly  88.68 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0061  tRNA-Gly  85.29 
 
 
75 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638683  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  90.91 
 
 
72 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt09  tRNA-Gly  85.29 
 
 
75 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt36  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0063  tRNA-Gly  85.29 
 
 
75 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4576  tRNA-Gly  85.29 
 
 
75 bp  56  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0004  tRNA-Gly  85.29 
 
 
75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54255  normal  0.0153905 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0850  tRNA-Gly  86.67 
 
 
76 bp  56  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.031083  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  85.29 
 
 
75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0001  tRNA-Gly  85.29 
 
 
75 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0042  tRNA-Gly  85.29 
 
 
75 bp  56  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0052  tRNA-Gly  85.29 
 
 
75 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  89.29 
 
 
73 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  85.29 
 
 
75 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0052  tRNA-Gly  85.29 
 
 
75 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.165358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0054  tRNA-Gly  85.29 
 
 
75 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.290496  normal  0.747562 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0060  tRNA-Gly  85.29 
 
 
75 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>