More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_R0041 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_R0041  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000613233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000854209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0070  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  97.06 
 
 
75 bp  119  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  97.06 
 
 
75 bp  119  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  97.06 
 
 
75 bp  119  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0038  tRNA-Gly  96.97 
 
 
75 bp  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0048  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0052  tRNA-Gly  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0050  tRNA-Gly  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0051  tRNA-Gly  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0062  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167826  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0052  tRNA-Gly  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0062  tRNA-Gly  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.588176  normal  0.0646028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1789  tRNA-Gly  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212776  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  93.94 
 
 
75 bp  99.6  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  93.94 
 
 
75 bp  99.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  93.94 
 
 
75 bp  99.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  93.94 
 
 
75 bp  99.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  93.94 
 
 
75 bp  99.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  92.65 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt36  tRNA-Gly  92.11 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt36  tRNA-Gly  92.11 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0053  tRNA-Gly  92.11 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2253  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82132  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0028  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.433481  normal  0.466553 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0044  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2331  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0152091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0006  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0005  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000151844  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0031  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000029648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0046  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.098729  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0241  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2245  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2165  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0891  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  90.67 
 
 
777 bp  93.7  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.101452  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1730  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.873105  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1755  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0031  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1978  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0053  tRNA-Gly  92.42 
 
 
75 bp  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000895644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0064  tRNA-Gly  91.43 
 
 
75 bp  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.729531  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0011  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.770603  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1545  tRNA-Gly  90.28 
 
 
72 bp  87.7  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0739  tRNA-Gly  90.28 
 
 
72 bp  87.7  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.158339  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1013  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0018  tRNA-Gly  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0031  tRNA-Gly  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046959  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0010  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.695097  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0909  tRNA-Gly  90.79 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0007  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264887  normal  0.61678 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0028  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0030  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000189578  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0006  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000670589  normal  0.608185 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0042  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443767  normal  0.830121 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0071  tRNA-Gly  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00174778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0033  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0406258  normal  0.16961 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.36527  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0855  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0035  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0213758  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0002  tRNA-Gly  94.55 
 
 
72 bp  85.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.231907  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0002  tRNA-Gly  94.55 
 
 
72 bp  85.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309363  tRNA-Gly  94.55 
 
 
72 bp  85.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0025  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  91.04 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0031  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0675454  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0069  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.494624  hitchhiker  0.00109102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0017  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000592681  hitchhiker  0.00000010486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0028  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.167752 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309288  tRNA-Gly  94.55 
 
 
72 bp  85.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0313014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0037  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0254902  normal  0.171485 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0017  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  90.91 
 
 
75 bp  83.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  91.43 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0020  tRNA-Gly  91.43 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0370755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0044  tRNA-Gly  95.92 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00080  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000419569  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0044  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.35893e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0083  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.37865e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5110  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5109  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5111  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000015095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.611211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA45  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000360899  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA59  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0609929  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2338  tRNA-Gly  89.47 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00378756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2337  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0125428  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0078  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67777  normal  0.517696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0077  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707613  normal  0.5241 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4279  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.4241200000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0012  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000103528  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0013  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000958382  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0014  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000460398  unclonable  0.00000183303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0051  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000228053  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0029  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432235  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0031  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.623556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>