More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_R0044 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0053  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000895644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  97.3 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  97.3 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  97.3 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0038  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  95.95 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  95.95 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0071  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00174778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0031  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0018  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0281  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000381106  hitchhiker  0.0000254958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt52  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.894326 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0020  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.748277  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0085  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000120136  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0030  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0059  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336039  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1578  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1613  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.610826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0026  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0170  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0068  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00365529  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0048  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0062  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt13  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0016  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0044  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.363029  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14880  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.67591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14032  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0017  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0023  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0016  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0020  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0027  tRNA-Gly  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00820  tRNA-Gly  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0044  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0041  tRNA-Gly  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00225081  hitchhiker  0.00893878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0038  tRNA-Gly  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499148  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0028  tRNA-Gly  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0025  tRNA-Gly  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0024  tRNA-Gly  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13850  tRNA-Gly  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15127  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  92 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0018  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0050  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0060  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.481193  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13870  tRNA-Gly  94.92 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0328341  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 72 bp  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 72 bp  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0612672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0024  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474961  hitchhiker  0.000422709 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0078  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0389379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0075  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.29937  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0079  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.556141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0112  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000299273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000174679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0858  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>