More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_R0010 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  97.37 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  97.37 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0004  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.679327 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt08  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.711822  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt09  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745225  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0045  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.471231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0055  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0060  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.766632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0061  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638683  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0001    90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0451223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0037  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0028  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000319369  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0005  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0060  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0959  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0004  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54255  normal  0.0153905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0001  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0055  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930206  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0063  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0015  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  hitchhiker  0.00133566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0052  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.165358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0054  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.290496  normal  0.747562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0024  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA4  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489059 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0060  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18005  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0002  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00924229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0058  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0052  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0028  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000877648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0177  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4576  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  92.06 
 
 		 72 bp  85.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  92.06 
 
 		 72 bp  85.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0839  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.343418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0003  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  92.06 
 
 		 72 bp  85.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0005  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0042  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0046  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  92.06 
 
 		 72 bp  85.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0007  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  90.77 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0068  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00365529  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11980  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000114191  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0062  tRNA-Gly  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.588176  normal  0.0646028 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11950  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000172827  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07190  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.886703 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0016  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0015  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  91.04 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  91.38 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0050  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165947  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0281  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000381106  hitchhiker  0.0000254958 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0018  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>