288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0003 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0055  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0096  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000621353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0002  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00924229  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0048  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0002  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.367155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0040  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0061  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0015  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0028  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000319369  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0048  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105769  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0070  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0057  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0036  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0024  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474961  hitchhiker  0.000422709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0025  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.157688  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4305  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0058  tRNA-Ala  89.58 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0350948  hitchhiker  0.00476067 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0069  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448955  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0049  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0009  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0007  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0043  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.782815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0059  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.000543343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0022  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0012  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0010  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00080  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000419569  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00081  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000257411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0044  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.35893e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0083  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.37865e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0085  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.68672e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0024  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000696404  hitchhiker  0.000000493359 
 
 
-
 
NC_002950  PGt18  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.611211  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t21  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA59  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0609929  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0042  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0022  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R50  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R61  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R63  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R65  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2616  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.256373  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4671  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.05705e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5109  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5039  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000010276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0049  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0099  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000502602  hitchhiker  0.0000112339 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0075  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000219757  hitchhiker  0.00000000043748 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0019  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0048  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000507488  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0049  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000555538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0055  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00145932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0050  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0100  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000550184  hitchhiker  0.000011037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4238  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.1159899999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2338  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00378756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2337  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0125428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0072  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000137146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0037  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.133837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2055  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000108601  hitchhiker  0.000600208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5111  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000015095  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0022  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000631988  hitchhiker  0.000000512691 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0707  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0600854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4725  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.64891e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5110  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0012  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000103528  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0013  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000958382  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0014  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000460398  unclonable  0.00000183303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0051  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000228053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0029  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432235  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0031  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.623556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0045  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.0236363 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0045  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0048  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0352694  hitchhiker  0.000658137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0077  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707613  normal  0.5241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0078  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67777  normal  0.517696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>