299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_R0050 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  95.65 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt52  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.894326 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt13  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt11  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0017  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000311098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0015  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5531599999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  98.08 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1467  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000429546  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1327  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0009  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0539709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1718  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000351586  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0019  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt18  tRNA-Gly  94.92 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0002  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.367155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0438  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2232  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000940116  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2192  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000563667  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1674  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000649019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0011  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0012  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0572972  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13870  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0328341  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0020  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.748277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0060  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.481193  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13850  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0023  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14880  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.67591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0017  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14032  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0016  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0020  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0016  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0044  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.363029  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0041  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00225081  hitchhiker  0.00893878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0025  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00820  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0009  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0024  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474961  hitchhiker  0.000422709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0006  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.285278  hitchhiker  0.0000641182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0066  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00320497 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0025  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42192  normal  0.527647 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0020  tRNA-Gly  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0370755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635466  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0028  tRNA-Gly  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0056  tRNA-Gly  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0051  tRNA-Gly  91.38 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0022  tRNA-Gly  92.59 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0368562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>