252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0051 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_R0051  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  94.74 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0053  tRNA-Gly  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000895644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0060  tRNA-Gly  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.481193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  91.89 
 
 
75 bp  99.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0062  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0048  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  90.28 
 
 
72 bp  87.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0071  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00174778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0018  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0038  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  91.53 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  87.67 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  87.67 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  87.5 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  87.5 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  87.5 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  87.5 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  87.5 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0031  tRNA-Gly  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046959  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  89.83 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0064  tRNA-Gly  87.88 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.729531  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  87.84 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  87.67 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  87.67 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  87.67 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  87.67 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  91.67 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0002  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.367155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0075  tRNA-Gly  88.14 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.29937  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0079  tRNA-Gly  88.14 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.556141  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  88.14 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  88.14 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  88.14 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0020  tRNA-Gly  97.14 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.748277  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  88.14 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0078  tRNA-Gly  88.14 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0389379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  86.3 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0023  tRNA-Gly  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  86.3 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  86.3 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  86.3 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  86.3 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0044  tRNA-Gly  86.3 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0017  tRNA-Gly  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  86.3 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0038  tRNA-Gly  86.3 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499148  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0002  tRNA-Gly  85.51 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0016  tRNA-Gly  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290546  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0020  tRNA-Gly  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0016  tRNA-Gly  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0044  tRNA-Gly  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.363029  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  86.3 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0001  tRNA-Gly  85.51 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67209  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14032  tRNA-Gly  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156026  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38700  tRNA-Gly  90.38 
 
 
74 bp  56  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0055  tRNA-Gly  84 
 
 
75 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930206  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  91.49 
 
 
74 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0041  tRNA-Gly  88.24 
 
 
75 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000613233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0043  tRNA-Gly  88.24 
 
 
75 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000854209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0070  tRNA-Gly  88.24 
 
 
75 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0028  tRNA-Gly  84 
 
 
75 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000319369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  87.04 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0020  tRNA-Gly  84.85 
 
 
75 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  96.67 
 
 
75 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  96.67 
 
 
75 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5730  tRNA-Gly  96.67 
 
 
75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  96.67 
 
 
78 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000299273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  96.67 
 
 
78 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000174679  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  96.67 
 
 
78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  87.04 
 
 
75 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4999  tRNA-Gly  96.67 
 
 
75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5718  tRNA-Gly  96.67 
 
 
75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273939  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0281  tRNA-Gly  96.67 
 
 
75 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000381106  hitchhiker  0.0000254958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  87.04 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5637  tRNA-Gly  96.67 
 
 
75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>