299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_R0064 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  95.65 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  93.85 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13850  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13870  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0328341  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369409  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0015  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5531599999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0017  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000311098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0025  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42192  normal  0.527647 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1327  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0009  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0539709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1718  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000351586  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1467  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000429546  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt18  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  92.19 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14880  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.67591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  92.19 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  92.19 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0020  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.748277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  92.19 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  94.92 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0041  tRNA-Gly  91.04 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00225081  hitchhiker  0.00893878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  91.04 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  91.04 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00820  tRNA-Gly  91.04 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0023  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0438  tRNA-Gly  92.42 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644893  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14032  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0017  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0016  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0020  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0016  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0044  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.363029  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0011  tRNA-Gly  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446743  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2192  tRNA-Gly  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000563667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0022  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0021  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.713807  normal  0.0150575 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0028  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1674  tRNA-Gly  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000649019  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2232  tRNA-Gly  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000940116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0028  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0012  tRNA-Gly  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0572972  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0020  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0005  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0096  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000621353  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0002  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.367155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0027  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0002  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00924229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0051  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>