298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_R0022 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_R0022  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0368562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0022  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0021  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.713807  normal  0.0150575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0028  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0028  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763177  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0027  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0050  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0053  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0044  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000615289  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0012  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000114825  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0001  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0654082  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0019  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07725  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0025  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0006  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.285278  hitchhiker  0.0000641182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0066  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00320497 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0021  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna21  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt36  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt36  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0044  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0345012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0044  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna23  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0042  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0041  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0043  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0043  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0822724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0032  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0007  tRNA-Gly  95.65 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.864337  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0061  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309207  tRNA-Gly  95.65 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0012  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0572972  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0039  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0010  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0183648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0035  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt18  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04003  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000136534  normal  0.315468 
 
 
-
 
NC_003295  RS04004  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000202158  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0032  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165397  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0007  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38046  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0036  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0048  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0045  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0047  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.686497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0008  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.521069  normal  0.137143 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0037  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.694382  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0037  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0034  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0011  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0020  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0370755  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0043  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.530353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369409  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0052  tRNA-Gly  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616527  hitchhiker  0.00092447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0015  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5531599999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0040  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0438  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644893  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1327  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0009  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0539709  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0058  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0015  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1718  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000351586  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1467  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000429546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0017  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000311098  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0044  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.35893e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0083  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.37865e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t34  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.286762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t35  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t61  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.58231  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA45  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000360899  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA57  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256598  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA59  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0609929  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0013  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0037  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.133837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27610  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0782148  hitchhiker  0.00257917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27620  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0363861  decreased coverage  0.00144796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30680  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00819815  hitchhiker  0.00300406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5039  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000010276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>