More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_R0027 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  97.37 
 
 		 75 bp  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  97.37 
 
 		 75 bp  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_002950  PGt13  tRNA-Gly  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt52  tRNA-Gly  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.894326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  97.3 
 
 		 75 bp  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  97.26 
 
 		 72 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0024  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474961  hitchhiker  0.000422709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0044  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0017  tRNA-Gly  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0016  tRNA-Gly  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0020  tRNA-Gly  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0016  tRNA-Gly  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0044  tRNA-Gly  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.363029  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14032  tRNA-Gly  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14880  tRNA-Gly  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.67591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0023  tRNA-Gly  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13850  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0020  tRNA-Gly  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.748277  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13870  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0328341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0053  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000895644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00820  tRNA-Gly  95.08 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0041  tRNA-Gly  95.08 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00225081  hitchhiker  0.00893878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  93.85 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0020  tRNA-Gly  93.85 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0370755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  94.83 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0038  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0024  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0046  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0038  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0018  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0004  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0025  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0028  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0027  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0030  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.949904  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0064  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173961  normal  0.106433 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07190  tRNA-Gly  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.886703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0071  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00174778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0018  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0031  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0281  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000381106  hitchhiker  0.0000254958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0112  tRNA-Gly  97.83 
 
 		 72 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  90.77 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0078  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  90.77 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt36  tRNA-Gly  90.77 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1578  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1613  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.610826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0026  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0170  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0030  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0059  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336039  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0085  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000120136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>