298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0054 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_002950  PGt52  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.894326 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.611211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0022  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0024  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t34  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.417453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0037  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.133837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0029  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0043  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000132411  normal  0.194852 
 
 
-
 
NC_002950  PGt13  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0025  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0041  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0038  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148988  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0037  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0039  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169853  normal  0.361721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0037  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0036  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.19079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0035  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0051  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000327476  normal  0.339785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0050  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00077941  normal  0.344918 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051021  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0495451  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0037  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0038  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0068  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00512241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2881  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2882  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1741  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0350949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1742  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0559851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0035  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0056  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00797069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0057  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000972569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0039  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00658177  decreased coverage  0.00000286482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0040  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00614875  decreased coverage  0.00000263085 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0019  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0020  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0021  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168076  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly02  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0035  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0035  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000173498  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0036  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000574217  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0037  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000566615  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0049  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00162631  normal  0.347035 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0036  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0033  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0034  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205379  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0035  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0038  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.351853 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0028  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0030  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000189578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2454  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.880044  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0036  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2826  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0217259  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2827  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0128974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2766  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0786611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2767  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0513521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2826  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2827  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1777  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00314954  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0020  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0043  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00341468  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0044  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.013329  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0045  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960605  normal  0.982559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00080  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000419569  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00081  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000257411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0044  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.35893e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0083  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.37865e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0085  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.68672e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0909  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4280  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000230122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2338  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00378756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t21  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t38  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt36  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt36  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA45  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000360899  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA57  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256598  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA59  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0609929  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5039  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000010276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4725  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.64891e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4724  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.56815e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5111  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000015095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5110  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5109  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4723  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.032e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0080  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.8513  normal  0.517696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4278  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.821950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0012  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000103528  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0013  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000958382  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0014  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000460398  unclonable  0.00000183303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0051  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000228053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0029  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432235  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0031  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.623556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0045  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.0236363 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1013  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4671  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.05705e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0048  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0352694  hitchhiker  0.000658137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>