294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_R0045 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0028  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000319369  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0026  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.453566  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_757  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0984996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0024  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.854506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0065  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0021  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0019  tRNA-Gly  88.57 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0044  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0031  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0019  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.537807  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0030  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0031  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0026  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446733  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0038  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.657012 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0001  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0003  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100529 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0019  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19030  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0004  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.679327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0009  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0005  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104558 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0021  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.953121  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0036  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0039  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0041  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0040  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0038  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0028  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0062  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.588176  normal  0.0646028 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0016  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0019  tRNA-Gly  88.33 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000618512  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0038  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000426137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0015  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209319  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_639  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000240622  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.850399  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000134783  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0039  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0060  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt08  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.711822  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt09  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0061  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638683  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0050  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0045  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.471231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0001    84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0451223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0015  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  hitchhiker  0.00133566 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0014  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298802  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0055  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0020  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0052  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0024  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0959  tRNA-Gly  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0052  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000156743  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0004  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54255  normal  0.0153905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0001  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0058  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0035  tRNA-Val  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0004  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.298901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA4  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0005  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118248  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0055  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0002  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00924229  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0052  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.165358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0063  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0021  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0023  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000214158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0037  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0037  tRNA-OTHER  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0060  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0024  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113773  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0060  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.766632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>