145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0035 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0035  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0039  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0206433  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0004  tRNA-Val  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_163  tRNA-Val  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-1  tRNA-Val  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0039  tRNA-Val  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0045  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00029215  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0083  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0036  tRNA-Val  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0044  tRNA-Met  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.477154  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.343772 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0041  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0038  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.978426  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0032  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0335468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0051  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0035  tRNA-Val  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0046  tRNA-Asp  90 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000106741  normal  0.144267 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t07  tRNA-Asp  90 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.802625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0041  tRNA-Asp  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0134468  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0001  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000207511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.84698e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19050  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0051  tRNA-Asp  90 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.681144  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0052  tRNA-Asp  90 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000156743  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0050  tRNA-Asp  90 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0024  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.508678  normal  0.235406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10340  tRNA-Val  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0379292 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1555  tRNA-Val  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0069  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0047  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14980  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.014365  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0012  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.212092  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0024  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.101826  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0023  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0011  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0067  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101529  hitchhiker  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0063  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0015  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0026  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0027  tRNA-Met  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.841138  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0011  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0049  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0374183  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0062  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0050  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0424906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0002  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0001  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0050  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0054  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0060  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0011  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0043  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0225474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0047  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.985232  normal  0.0659545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0049  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0012  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0020  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.152661  normal  0.0163497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0021  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097858  normal  0.0168782 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0025  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.279282  normal  0.0688605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0050  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0359841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0051  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0068  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.147043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0012  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000664581  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0676778  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0054  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69639  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0029  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0127801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0094  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0058  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0090  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0025  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0026  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0027  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0050  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.540362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>