179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_R0032 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.101826  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0491  tRNA-Arg  97.26 
 
 
73 bp  129  9.000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg01  tRNA-Arg  91.84 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000810736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0090  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0120  tRNA-Arg  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0536302  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0007  tRNA-Arg  92.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0004  tRNA-Arg  89.58 
 
 
77 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2557  tRNA-Arg  89.58 
 
 
77 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.55794e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0082  tRNA-Arg  89.58 
 
 
77 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0058  tRNA-Arg  88 
 
 
77 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.11838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0021  tRNA-Arg  86.21 
 
 
73 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191091  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0007  tRNA-Arg  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0009  tRNA-Arg  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0015  tRNA-Arg  88 
 
 
77 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.776869  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00067  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000401991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0107  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  9.38441e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4157  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0034  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4142  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000739333  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5230  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196112  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4260  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000095495  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4211  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000122851  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0003  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0001  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.916534 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0056  tRNA-Arg  87.76 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0097  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000263693  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0089  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4319  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000432818  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4199  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.81521e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4710  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.38627e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5087  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000056915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0003  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000103446  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0525  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000996192  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0008  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000368398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0001  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.265637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0091  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0042  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00513283  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0124  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000592514  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4161  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189132  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4322  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.17442e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3097t  tRNA-Arg  87.5 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106477  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna022  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000131099  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0809  tRNA-Arg  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.770269  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0043  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.343772 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0012  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00485  tRNA-Arg  87.5 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0054  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0032  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0335468  normal 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.893816  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0023  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.247152  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0024  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000157655  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0023  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000339625  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0050  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.540362  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0044  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.477154  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0048  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.459863  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0054  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0060  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0011  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0067  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0022  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0025  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.279282  normal  0.0688605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0065  tRNA-Arg  88.37 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0045  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00029215  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0012  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000664581  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0035  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0016  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0676778  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0016  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69639  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  100 
 
 
80 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-7  tRNA-Met  100 
 
 
80 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0050  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0424906  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0055    86.96 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.594029  normal 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-3  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000104946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>