46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0491 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0491  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0032  tRNA-Arg  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.101826  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg01  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 80 bp  60  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000810736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0090  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0120  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0536302  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0009  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0021  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0007  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30020  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00306954  normal  0.612102 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0809  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.770269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0007  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0056  tRNA-Arg  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06030  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.936172  hitchhiker  0.000000000387483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0082  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2557  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.55794e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0004  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0065  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0015  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.776869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0058  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.11838  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0089  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0034  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0001  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.916534 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0525  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000996192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0091  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0008  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000368398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0001  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.265637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5230  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4319  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000432818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4157  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4142  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000739333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4260  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000095495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4211  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000122851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4322  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.17442e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4161  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0124  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000592514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0042  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00513283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00067  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000401991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0003  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000103446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5087  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000056915  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4710  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.38627e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4199  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.81521e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0097  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000263693  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0003  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.893816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0107  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  9.38441e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>