99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06030 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_06030  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.936172  hitchhiker  0.000000000387483 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0058  tRNA-Arg  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09170  tRNA-Arg  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.155256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09780  tRNA-Arg  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0646814  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0052  tRNA-Arg  95.89 
 
 
73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.179946  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0050  tRNA-Arg  95.89 
 
 
73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000306813 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0018  tRNA-Arg  95.83 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594748  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0083  tRNA-Arg  94.52 
 
 
73 bp  113  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0039  tRNA-Arg  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198165  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0043  tRNA-Arg  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0039  tRNA-Arg  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.780721  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0042  tRNA-Arg  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0415114  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19370  tRNA-Arg  93.33 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0026  tRNA-Arg  93.33 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0263257  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14018  tRNA-Arg  93.24 
 
 
76 bp  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0022  tRNA-Arg  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.99617  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0010  tRNA-Arg  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07940  tRNA-Arg  94.2 
 
 
76 bp  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00762126  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0014  tRNA-Arg  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.951342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0017  tRNA-Arg  93.44 
 
 
73 bp  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121819  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0051  tRNA-Arg  92.31 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0856263  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg01  tRNA-Arg  88.06 
 
 
80 bp  61.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000810736  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0020  tRNA-Arg  88.14 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0056  tRNA-Arg  87.1 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0042  tRNA-Arg  89.8 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0042  tRNA-Arg  89.8 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0041  tRNA-Arg  89.8 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00815383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0065  tRNA-Arg  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0035  tRNA-Arg  89.8 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.16654  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0029  tRNA-Arg  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0048  tRNA-Arg  85.53 
 
 
75 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0007  tRNA-Arg  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000148422  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0054  tRNA-Arg  89.36 
 
 
77 bp  54  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  hitchhiker  0.000271304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0021  tRNA-Arg  86.44 
 
 
73 bp  54  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191091  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0041  tRNA-Pro  96.77 
 
 
75 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000127927 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0086  tRNA-Arg  94.12 
 
 
75 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0018  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000808777  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0016  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  hitchhiker  0.00000369397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0069  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.092097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14014  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0491  tRNA-Arg  85.96 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0091  tRNA-Arg  87.72 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486376  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721893  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12440  tRNA-Pro  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0015  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.776869  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0047  tRNA-Arg  84.21 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0022  tRNA-Arg  90 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00454117  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1390  tRNA-Arg  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1378  tRNA-Pro  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24820  tRNA-Arg  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.173239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0015  tRNA-Arg  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30020  tRNA-Arg  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00306954  normal  0.612102 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna022  tRNA-Arg  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000131099  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0057  tRNA-Arg  86.27 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23950  tRNA-Arg  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0625654  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0035  tRNA-Pro  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000197485  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0023  tRNA-Arg  87.27 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t26  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199412  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0029  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t25  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0079  tRNA-Lys  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0040  tRNA-Pro  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0043  tRNA-Pro  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0225474  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0035  tRNA-Arg  85.07 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R70  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000026537  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0049  tRNA-Arg  86.27 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00485  tRNA-Arg  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R69  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000230039  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R68  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247988  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA55  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00383628  normal  0.467679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA54  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00144868  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0046  tRNA-Pro  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.372739  normal  0.328278 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3097t  tRNA-Arg  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0026  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 
71 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0032  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309128  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.696434  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309094  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.220954  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309096  tRNA-Pro  100 
 
 
69 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.185  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAProVIMSS1309194  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309294  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309169  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0061  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0026  tRNA-Pro  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0020  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951008  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05971  hypothetical protein  100 
 
 
207 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0437067  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAProVIMSS1309374  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0037  tRNA-Arg  86 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09140  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0616263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0041  tRNA-Arg  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00651741  normal  0.289964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>