61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_R0086 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_R0086  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0091  tRNA-Arg  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0048  tRNA-Arg  94.74 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0043  tRNA-Arg  94.64 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.473325  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0042  tRNA-Arg  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0032  tRNA-Arg  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0034  tRNA-Arg  91.23 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00361303  normal  0.0286488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0069  tRNA-Arg  91.23 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0014  tRNA-Arg  91.23 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0048  tRNA-Arg  91.23 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0506396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0049  tRNA-Arg  91.23 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.428212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0009  tRNA-Arg  91.07 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.184283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0045  tRNA-Arg  91.07 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0128095  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0065  tRNA-Arg  91.07 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0017  tRNA-Arg  91.07 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0801926 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0020  tRNA-Arg  88.16 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0015  tRNA-Arg  92 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165278  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18410  tRNA-Arg  89.47 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0950297  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0052  tRNA-Arg  87.69 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.108148  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0049  tRNA-Arg  89.47 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198977  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0022  tRNA-Arg  89.47 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00454117  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0047  tRNA-Arg  89.47 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0012  tRNA-Arg  89.29 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251285  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0047  tRNA-Arg  84.81 
 
 
79 bp  60  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116443  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0051  tRNA-Arg  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0856263  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09170  tRNA-Arg  94.29 
 
 
76 bp  54  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.155256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0018  tRNA-Arg  94.29 
 
 
76 bp  54  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594748  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0045  tRNA-Arg  94.29 
 
 
76 bp  54  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06030  tRNA-Arg  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.936172  hitchhiker  0.000000000387483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0039  tRNA-Arg  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.780721  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0026  tRNA-Arg  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0263257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0042  tRNA-Arg  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0415114  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07940  tRNA-Arg  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00762126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0050  tRNA-Arg  94.12 
 
 
73 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000306813 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0083  tRNA-Arg  94.12 
 
 
73 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09780  tRNA-Arg  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0646814  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  92.11 
 
 
73 bp  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0010  tRNA-Arg  94.12 
 
 
73 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14018  tRNA-Arg  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0022  tRNA-Arg  94.12 
 
 
73 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.99617  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0052  tRNA-Arg  94.12 
 
 
73 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.179946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0039  tRNA-Arg  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198165  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0043  tRNA-Arg  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0017  tRNA-Arg  91.89 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121819  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0016  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.228908 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0077  tRNA-Arg  84.21 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0021  tRNA-Arg  90 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191091  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0014  tRNA-Arg  90 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.951342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0040  tRNA-Arg  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000151754  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0054  tRNA-Arg  90.7 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  hitchhiker  0.000271304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0068  tRNA-Val  96.15 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.064456  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0058  tRNA-Arg  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19370  tRNA-Arg  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0042  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0042  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0035  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.16654  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0041  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00815383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>