52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0018 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0018  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09170  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.155256 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06030  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.936172  hitchhiker  0.000000000387483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0010  tRNA-Arg  98.28 
 
 		 73 bp  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07940  tRNA-Arg  98.28 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00762126  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14018  tRNA-Arg  98.28 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0022  tRNA-Arg  98.28 
 
 		 73 bp  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.99617  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0039  tRNA-Arg  98.28 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0043  tRNA-Arg  98.28 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0039  tRNA-Arg  98.28 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.780721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0026  tRNA-Arg  98.28 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0263257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0042  tRNA-Arg  98.28 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0415114  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0052  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.179946  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0050  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000306813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09780  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0646814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0058  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0083  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19370  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0017  tRNA-Arg  91.94 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121819  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0014  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.951342 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0051  tRNA-Arg  97.44 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0856263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0041  tRNA-Arg  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00815383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0035  tRNA-Arg  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.16654  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0042  tRNA-Arg  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0042  tRNA-Arg  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0029  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0015  tRNA-Arg  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.776869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0065  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0086  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0020  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0054  tRNA-Arg  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0006  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0091  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0041  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000127927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0056  tRNA-Arg  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0007  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000148422  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0054  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  hitchhiker  0.000271304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0022  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00454117  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0065  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.226717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0005  tRNA-Arg  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0048  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109665  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309277  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.203232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0057  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434776 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg01  tRNA-Arg  86 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000810736  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0050  tRNA-Arg  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.347664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0039  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0021  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t47  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.704703  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0009  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.152729 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0040  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>