90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_R0057 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0049  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0009  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000808777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0005  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000297571  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0017  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0018  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0046  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.979271  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0015  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0022  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0053  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.30391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14014  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0046  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.455447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0043  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924826  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0011  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0022  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0048  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358997  normal  0.0149613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0043  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0011  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0018  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0010  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0049  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00163876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0030  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1462  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149673  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000165448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0047  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070675  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0004  tRNA-Arg  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0002  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0028  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0094  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0061  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000631723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0016  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  hitchhiker  0.00000369397 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0010  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0002  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000443996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0077  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32790  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0086  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0098  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0026  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000798043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000179281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3129t  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_326  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00688078  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0039  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0291069  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3131t  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3132t  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3133t  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3134t  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0018  tRNA-Arg  85.94 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000291564  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3135t  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0050  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t089  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t088  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0064  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00996897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0065  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00979442  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0043  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000076274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0045  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000811404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0047  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0049  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0044  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000145436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0046  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000251633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0048  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000258429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0042  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000133594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0044  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000151065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0013  tRNA-Arg  85.94 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0697011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t083  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0046  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0048  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0051  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.524822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t087  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0007  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000187685  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0011  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00060097 
 
 
-
 
NC_006368  lppt19  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt18  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0016  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000000601684  hitchhiker  0.000695383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0029  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0052  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.717648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24430  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257328  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0010  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000576852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0020  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.845791  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0012  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000569995 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0016  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.190715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0020  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0817304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0003  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30640  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.587874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0020  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0046  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0024  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0059  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000542339  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0048  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00910953  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0071  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0216295  normal  0.909849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>