97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_R0049 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00163876  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000165448  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1462  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149673  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0010  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0030  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0022  tRNA-Arg  96.23 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0047  tRNA-Arg  93.22 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070675  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0005  tRNA-Arg  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000297571  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0004  tRNA-Arg  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0024  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921626 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309121  tRNA-Arg  97.44 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.206982  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000808777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0004  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000356411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0016  tRNA-Arg  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000000601684  hitchhiker  0.000695383 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0004  tRNA-Arg  95 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0200827  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309146  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.465362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0011  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0057  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194543  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0042  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0016  tRNA-Arg  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  hitchhiker  0.00000369397 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0013  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0697011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0006  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0055  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300592 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0085  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000064682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0055  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0855859  hitchhiker  0.00187773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0051  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110846 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0018  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000291564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309364  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0015  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0299622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0045  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0024  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.826949  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309188  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.451708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0003  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.611935  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0017  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0629  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0015  tRNA-Arg  90 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0036  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154889  normal  0.245058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0048  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000768741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0050  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0046  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.979271  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0018  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0061  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000631723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0098  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0038  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0033  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0017  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0053  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.30391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0009  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122464  normal  0.0281964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0025  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0720614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0033  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0109  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0034  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0008  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0011  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0010  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410032  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0008  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0006  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0026  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335207  hitchhiker  0.00751265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA31  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0011  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0002  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0003  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0051  tRNA-Arg  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.23821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0028  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0094  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0022  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00187223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309273  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160007  hitchhiker  0.00825828 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0049  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24430  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257328  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0004  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0535  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.266332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00110429  normal  0.148154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0010  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0038  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0069  tRNA-Met  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.51263  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_326  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00688078  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000179281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0013  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0934099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0051  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0026  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200362  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0024  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0026  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0948  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.391467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0019  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0051  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0007  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000187685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>