170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_R0069 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_R0069  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0038  tRNA-Met  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0025  tRNA-Met  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0720614  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0010  tRNA-Met  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0003  tRNA-Met  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0038  tRNA-Met  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.545151  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0252  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0041  tRNA-Met  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0043  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.259921  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0037  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0043  tRNA-Met  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.931817  normal  0.538604 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t28  tRNA-Met  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0044  tRNA-Met  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0084  tRNA-Lys  88.52 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0014  tRNA-Met  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65159  normal  0.954278 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1025  tRNA-Met  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0262205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0034  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0028  tRNA-Met  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570656  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1546  tRNA-Met  86.89 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0022  tRNA-Met  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0058  tRNA-Met  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0043  tRNA-Met  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0027  tRNA-Met  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0001  tRNA-Lys  88.52 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0487853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0051  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.584124  normal  0.75185 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0022  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0003  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.611935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0005  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000297571  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309121  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.206982  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_R0080  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161915  normal  0.0753371 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_R0089  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000256192  normal  0.667344 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_R0086  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00192054  normal  0.222776 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00102646  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0014  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000169061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0003  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281638  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0019  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.47791e-17  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0028  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.79359e-16  unclonable  0.0000000519996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0040  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0004  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1474  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000230353  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1909  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164589  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0085  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000813778  normal  0.199045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0016  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000072024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0026  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000721993  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0074  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000283868  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0002  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000230131  normal  0.891298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0002  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0038  tRNA-Met  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0167531  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2046  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000148192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1097  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000222375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2897  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0061  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000544975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0066  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000012861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0039  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000372994  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0054  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0065  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00130991  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0072  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00108328  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0084  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0008  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000162248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0018  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000054904  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0066  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000013609  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0083  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000284492  normal  0.0190641 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0089  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000671858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0008  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000320674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0017  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000962066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0064  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0080  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000338502  normal  0.0447756 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0083  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00594726  hitchhiker  0.00848998 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0080  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000523506  normal  0.960372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0031  tRNA-Met  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0043725  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0073  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000270746  normal  0.313667 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0630  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000358951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3108  tRNA-OTHER  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0084  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000150317  normal  0.67216 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0008  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000057539  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0068  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00409998  normal  0.989602 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0004  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000259664  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0928  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000151896  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0701  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000189505  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1988  tRNA-OTHER  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000295907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1329  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00168049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3542  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000176081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3771  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0592  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000232315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1338  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3568  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0990712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3832  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0495  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328394  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0904  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0066867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1897  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000326046  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0451  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000861807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3541  tRNA-OTHER  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00194586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0066  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14007  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0236309 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0018  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000206561  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0008  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000588421  hitchhiker  0.00941116 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0020  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0021  tRNA-Met  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0005  tRNA-Ile  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000238444  hitchhiker  0.00232572 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>