156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_tRNAArgVIMSS1309121 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309121  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.206982  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0042  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309146  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.465362  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0003  tRNA-Arg  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.611935  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0024  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.826949  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0004  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309188  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.451708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309273  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309364  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0004  tRNA-Arg  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000356411  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0051  tRNA-Arg  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0055  tRNA-Arg  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300592 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0050  tRNA-Arg  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0013  tRNA-Trp  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156686  normal  0.0425769 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0049  tRNA-Arg  97.44 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00163876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0024  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0017  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0033  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0033  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0045  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0011  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0018  tRNA-Arg  97.22 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000291564  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000165448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0029  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0010  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1462  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149673  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0018  tRNA-Thr  94.87 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.46927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0016  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000000601684  hitchhiker  0.000695383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0098  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0045  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0010  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410032  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0057  tRNA-Arg  90.74 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324557  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0031  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0048271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0001  tRNA-Arg  90.74 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0005  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000297571  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0009  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000152408  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0019  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775653 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0718  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.953055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0001  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000737901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0022  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0009  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122464  normal  0.0281964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0008  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0006  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0008  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0085  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000064682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA31  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0011  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.87033e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0022  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00187223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0069  tRNA-Met  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0036  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154889  normal  0.245058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0053  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.30391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0001  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.486305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0948  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.391467  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0013  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000258053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0021  tRNA-Arg  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00687785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0050  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128438 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0053  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0041  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000701691  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0022  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0027696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0015  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000253898  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0004  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0200827  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0629  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0014  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0177881  hitchhiker  0.00685945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0033  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.258005  decreased coverage  0.00480976 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0001  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.200882  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0002  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0030  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0047  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070675  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0004  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0044  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0169442  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t21  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542798  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1404  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000898104 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0043  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0476411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 94 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0001  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1212  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0036  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.868247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0034  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0022  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000272434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0088  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.706466  normal  0.421027 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0009    84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.956254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0017  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0018  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0024  tRNA-OTHER  93.55 
 
 		 101 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>