299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_AR0038 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_AR0038  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0167531  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0036  tRNA-Met  91.78 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.572801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13990  tRNA-Met  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314954  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0043  tRNA-Met  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0063  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0011  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0006  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0037  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2335  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0022  tRNA-Met  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0050  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.325417  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0005  tRNA-Met  96.23 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.245348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0019  tRNA-Met  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0001  tRNA-Met  94.64 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.103849  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0035  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60320  tRNA-Met  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0052  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0246441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0033  tRNA-Met  92.59 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.311584 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  90 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06700  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0025  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0033  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000189228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0013  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0032  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07470  tRNA-Met  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349913  normal  0.175912 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0043  tRNA-Met  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.259921  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0031  tRNA-Met  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0043725  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0028  tRNA-Met  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882337  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0072  tRNA-Met  94 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571883  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0039  tRNA-Met  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474012  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0034  tRNA-Met  90.74 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0032  tRNA-Met  90.74 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366508  normal  0.496339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0041  tRNA-Met  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241337  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0031  tRNA-Met  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0079  tRNA-Met  94 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0501725  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0028  tRNA-Met  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.260556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0037  tRNA-Met  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00056  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.366108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0013  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.046309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0025  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3363  tRNA-Met  91.23 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3473  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.103015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5058  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0017  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3569  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3658  tRNA-Met  91.23 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0080  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0819155  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4699  tRNA-Met  91.23 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0029  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5070  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0389718  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0041  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0236723 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3467  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154969 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0015  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4687  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00526927  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3399  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143765  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3403  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4382  tRNA-Met  91.23 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.156688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0018  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.689825  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0022  tRNA-Met  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0017  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0140072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0020  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235412  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t04  tRNA-Met  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t02  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA75  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0008  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0075  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0090  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0076  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0005  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125114  hitchhiker  0.00000268461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0027  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0579561  normal  0.867818 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  89.29 
 
 		 80 bp  63.9  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1376  tRNA-Met  97.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0053  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14024  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0040  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R95  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0021  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0055  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0266099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0014  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170576  normal  0.370354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0041  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0024  tRNA-Met  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000192753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000169061  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0701  tRNA-Ile  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000189505  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0028  tRNA-Ile  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.79359e-16  unclonable  0.0000000519996 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0018  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0904  tRNA-Ile  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0066867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1988  tRNA-OTHER  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000295907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1097  tRNA-Ile  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000222375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2897  tRNA-Ile  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3094  tRNA-Ile  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516421  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0928  tRNA-Ile  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000151896  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0092  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1329  tRNA-Ile  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00168049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3832  tRNA-Ile  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0064  tRNA-Ile  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0022  tRNA-Met  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.09062 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0004  tRNA-Ile  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000259664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>