13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_R0049 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160007  hitchhiker  0.00825828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00110429  normal  0.148154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0007  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0009  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0032  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0441272 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0023  tRNA-Arg  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000165448  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00163876  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1462  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149673  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309183  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.609025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309275  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309359  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>