23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0032 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0441272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0007  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0009  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0065  tRNA-Arg  91.78 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0049  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160007  hitchhiker  0.00825828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0043  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00110429  normal  0.148154 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0023  tRNA-Arg  88.41 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0022  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0070  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.644432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0013  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.195236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0050  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02560  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.574761  hitchhiker  0.000017399 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0020  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801009 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0016  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  hitchhiker  0.00000369397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0048  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000768741  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0060  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.530052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0053  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673095  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna24  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08860  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00968271  normal  0.0225487 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0314744  normal  0.604641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>