73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_R0016 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_R0016  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000000601684  hitchhiker  0.000695383 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t05  tRNA-Arg  91.94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0022  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0027696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0014  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0177881  hitchhiker  0.00685945 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0002  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0053  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0005  tRNA-Arg  97.44 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000297571  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000165448  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1462  tRNA-Arg  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149673  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0049  tRNA-Arg  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00163876  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0017  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0033  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0033  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335539  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0034  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA31  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0022  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00187223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0009  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000649352 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309146  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.465362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0057  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0010  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410032  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309188  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.451708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309364  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309121  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.206982  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0098  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0042  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0004  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0003  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.611935  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0024  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.826949  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0008  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0024  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921626 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0022  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0047  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070675  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0006  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0006  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0055  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0855859  hitchhiker  0.00187773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0030  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0008  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0009  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122464  normal  0.0281964 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0032  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0026  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335207  hitchhiker  0.00751265 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0027  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.970154  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0051  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0029  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0055  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300592 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309273  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000808777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0718  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.953055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0011  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0004  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0101  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0010  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0008  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0009    91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.956254 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0094  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0026  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000798043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0002  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000443996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0036  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154889  normal  0.245058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0046  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.979271  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0057  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0018  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0029  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0053  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.30391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0013  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0697011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0011  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0017  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0048  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000768741  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0015  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0011  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0010  tRNA-Arg  85.07 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0048  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0002  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>