67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_t05 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_t05  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0057  tRNA-Arg  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324557  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0053  tRNA-Arg  95.71 
 
 		 73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0022  tRNA-Arg  95.71 
 
 		 73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0027696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0002  tRNA-Arg  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0014  tRNA-Arg  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0177881  hitchhiker  0.00685945 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0009  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 73 bp  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000649352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0027  tRNA-Arg  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.970154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0029  tRNA-Arg  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t28  tRNA-Arg  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0031  tRNA-Arg  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.032059  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0034  tRNA-Arg  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000102634  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0033  tRNA-Arg  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000528096  normal  0.244498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0016  tRNA-Arg  91.94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000000601684  hitchhiker  0.000695383 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0031  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0016  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  hitchhiker  0.00000369397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0006  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0055  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0855859  hitchhiker  0.00187773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0047  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070675  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0030  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0048  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000768741  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.792463  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0645499  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0040  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0022  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0026  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_629  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1373  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000017681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0011  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0018  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0041  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00651741  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0009  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000808777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0011  tRNA-Arg  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0055  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0052  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.108148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0019  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30020  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00306954  normal  0.612102 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0061  tRNA-Arg  84.13 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0020  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213818  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0004  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0018  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0046  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0052  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0058  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.605356  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0070  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.187227  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0040  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.111959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0049  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13110  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0488167  normal  0.646736 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0094  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0017  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30640  tRNA-Arg  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.587874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0022  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0015  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0685094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0046  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.979271  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0019  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0058  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0013  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0697011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0809  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.770269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0063  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0045  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.165882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0019  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0005  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0010  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0833672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>