44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_t28 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_t28  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122448  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0033  tRNA-Arg  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000528096  normal  0.244498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0034  tRNA-Arg  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000102634  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0031  tRNA-Arg  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.032059  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0031  tRNA-Arg  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0027  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.970154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t05  tRNA-Arg  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0057  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324557  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0029  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0002  tRNA-Arg  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0022  tRNA-Arg  88.57 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0027696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0014  tRNA-Arg  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0177881  hitchhiker  0.00685945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0053  tRNA-Arg  88.57 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0009  tRNA-Arg  87.14 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000649352 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0052  tRNA-Arg  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.108148  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0040  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.111959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0049  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0055  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0045  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.165882  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0016  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  hitchhiker  0.00000369397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0005  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0070  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.187227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0019  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0063  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0004  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0018  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0052  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0046  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0058  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.605356  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13662  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07697  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1137 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna051  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000648525  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0051  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.484505  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0035  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115961  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0017  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0011  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30020  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00306954  normal  0.612102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0041  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00651741  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00234  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0019  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0809  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.770269  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0020  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>