65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_R0022 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0027696  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0177881  hitchhiker  0.00685945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0009  tRNA-Arg  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000649352 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t05  tRNA-Arg  95.71 
 
 
76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0057  tRNA-Arg  95.71 
 
 
73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0027  tRNA-Arg  91.43 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.970154  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0031  tRNA-Arg  90 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.032059  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0029  tRNA-Arg  90 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0033  tRNA-Arg  90 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000528096  normal  0.244498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0034  tRNA-Arg  90 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000102634  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t28  tRNA-Arg  88.57 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0016  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000000601684  hitchhiker  0.000695383 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0031  tRNA-Arg  87.14 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0048  tRNA-Arg  95.45 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000768741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0016  tRNA-Arg  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  hitchhiker  0.00000369397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0011  tRNA-Arg  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721893  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0011  tRNA-Arg  89.58 
 
 
73 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486376  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0047  tRNA-Arg  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070675  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0017  tRNA-Arg  90.7 
 
 
73 bp  54  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0030  tRNA-Arg  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309121  tRNA-Arg  91.11 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.206982  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1373  tRNA-Arg  85.96 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000017681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0010  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410032  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0629  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0018  tRNA-Arg  87.5 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0029  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323491  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0098  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0094  tRNA-Arg  88.64 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0071  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0216295  normal  0.909849 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0070  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.187227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0006  tRNA-Arg  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0022  tRNA-Arg  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0005  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0019  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0045  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.165882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0063  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0015  tRNA-Arg  88.37 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0009  tRNA-Arg  89.74 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000808777  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0004  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0018  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0046  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0052  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0058  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.605356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0055  tRNA-Arg  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0855859  hitchhiker  0.00187773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0046  tRNA-Arg  88.37 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.979271  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0053  tRNA-Arg  88.1 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.30391  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0055  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0010  tRNA-Arg  83.87 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0059  tRNA-Arg  96.15 
 
 
73 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0019  tRNA-Arg  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2337  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0586  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177308  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000764457 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0013  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0697011  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0049  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0040  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.111959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0011  tRNA-Arg  88.1 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966891  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.403719 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0809  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.770269  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0010  tRNA-Arg  93.33 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0833672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0001  tRNA-Arg  96.15 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263223  normal  0.0193915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>