83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_R0018 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_R0070  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.187227  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0058  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.605356  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0052  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0046  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0018  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0004  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0051  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.484505  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0035  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115961  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0017  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0011  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13662  tRNA-Ile  93.94 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07697  tRNA-Ile  93.94 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0012  tRNA-Ile  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.021618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt04  tRNA-Ile  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000322453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0048  tRNA-Ile  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.884933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0054  tRNA-Ile  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt31  tRNA-Ile  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt37  tRNA-Ile  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_002950  PGt46  tRNA-Ile  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0036  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0044  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000172197  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0014  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tIle01  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0073  tRNA-Val  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618922  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0040  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.111959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0074  tRNA-Val  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.593802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0066  tRNA-Val  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.603715  normal  0.0472692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0055  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0049  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02186  tRNA-Val  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna123  tRNA-Val  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.193593  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t28  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122448  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t05  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02187  tRNA-Val  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0027696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000649352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0177881  hitchhiker  0.00685945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna44  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0040  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_R0076  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0054  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0017  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000274688  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0025  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.032059  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000102634  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000528096  normal  0.244498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t01  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0029  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804432  normal  0.0419406 
 
 
-
 
NC_003295  RS05795  tRNA-OTHER  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna124  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0010  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116783  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0041  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0021  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R68  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R69  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000230039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R70  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000026537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0049  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00100813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0005  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0019  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0045  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.165882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0063  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0223  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0090777  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0050  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0857362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0015  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000941457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0080  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217837  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0088  tRNA-Val  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.109488  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0041  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.970154  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0020  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.649475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA55  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00383628  normal  0.467679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA54  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00144868  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_006369  lplt32  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt32  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t26  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t25  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205972  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0005  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.964403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0045  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00877282  normal  0.995576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0010  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0001  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0034  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>