More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_R0044 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_R0044  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000172197  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0014  tRNA-Ile  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0026  tRNA-Ile  97.3 
 
 		 74 bp  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tIle01  tRNA-Ile  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0051  tRNA-Ile  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.484505  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0017  tRNA-Ile  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13662  tRNA-Ile  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07697  tRNA-Ile  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0035  tRNA-Ile  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115961  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0011  tRNA-Ile  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt04  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000322453 
 
 
-
 
NC_002950  PGt31  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt37  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_002950  PGt46  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0054  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00001  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00294227  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00061  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0509967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00071  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0100739  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0004  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00111877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0077  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000248576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0102  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00845186  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0016  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0006  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000238221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5092  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866499  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5077  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000584569  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4375  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.120949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0097  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0278  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00714159  normal  0.415657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4344  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0232585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0273  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124539  normal  0.840677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4375  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000507491  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4219  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00450756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5291  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000449228  normal  0.256663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0002  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.227542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0085  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0425046  normal  0.137972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4539  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00250858  hitchhiker  0.00000000000409662 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5004  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000283414  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0090  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000296834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4714  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504108  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0196  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0100  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806479  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0094  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00126026  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0292  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000120643  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4196  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0226265  normal  0.767758 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4458  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000985365  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4123  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000989752  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0013  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0016  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00171399  hitchhiker  0.0041284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4704  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4600  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000666504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0213  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000151155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4268  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00604993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0273  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0036281  normal  0.436112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0289  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0256101  normal  0.468385 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0006  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0108839  normal  0.0634944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4462  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397855  hitchhiker  0.000732879 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0028  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0390345  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4315  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0699439  normal  0.201928 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4641  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000032657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0079  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.115073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3573  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000468269  normal  0.424687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0084  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0568222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0020  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00394718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0092  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00539323  decreased coverage  0.00141538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0103  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00507683  decreased coverage  0.00339417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0214  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00923178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0119  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000630461  hitchhiker  0.0000581532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0010  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0425251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0057  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0012  tRNA-Val  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0001  tRNA-Ile  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522467  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0005  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000353567  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna079  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0722838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna039  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00772194  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna157  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0104  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000615074  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0626  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339545  normal  0.0175706 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0059  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000373197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0468  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000056688  normal  0.0165845 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0011  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0062166  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0005  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000168156  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle01  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle02  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0011  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000846583  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4293  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000401395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4265  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000229393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4204  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000054398  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0007  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000593812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0017  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000136136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0058  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00171421  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0127  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000449492  normal  0.0406776 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0046  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000007266  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0003  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000253245  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0026  tRNA-Ile  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0180152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0052  tRNA-Ile  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0042  tRNA-Ile  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00111432  normal  0.385328 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0031  tRNA-Ile  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>