More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0040 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_R0040  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0038  tRNA-Ile  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0085  tRNA-Ile  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  98.08 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  98.08 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  98.08 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  98.08 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  98.08 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  92.65 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  92.65 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  98.08 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  98.08 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  94.92 
 
 
74 bp  93.7  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  94.92 
 
 
77 bp  93.7  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  94.92 
 
 
77 bp  93.7  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  94.92 
 
 
77 bp  93.7  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0029  tRNA-Ile  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.303638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  98 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  98 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  98 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0013  tRNA-Ile  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0131677  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0029  tRNA-Ile  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0019  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000162954  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0015  tRNA-Ile  96.15 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  96.15 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  96.15 
 
 
80 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  96.15 
 
 
80 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  96.15 
 
 
80 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  96.15 
 
 
80 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  96.15 
 
 
80 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  96.15 
 
 
80 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  96.15 
 
 
80 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  96.15 
 
 
80 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  96.15 
 
 
80 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  96.15 
 
 
80 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  96.15 
 
 
80 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  96.15 
 
 
80 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0055  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000271401  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0025  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0795  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0069  tRNA-Ile  96.15 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  96.15 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0007  tRNA-Ile  96.08 
 
 
74 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00629205  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0035  tRNA-Ile  93.22 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.15056  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0030  tRNA-Ile  93.22 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0121  tRNA-Ile  96 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370837  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0051  tRNA-Ile  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00198263  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0089  tRNA-Ile  96 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0099  tRNA-Ile  96 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0002  tRNA-Ile  96 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0110  tRNA-Ile  96 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436648  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0009  tRNA-Ile  96 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0019  tRNA-Ile  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000012543  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  96 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0008  tRNA-Ile  96 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0002  tRNA-Ile  96 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1568  tRNA-Ile  96 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1603  tRNA-Ile  96 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.840001 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1800  tRNA-Ile  96 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21567e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1806  tRNA-Ile  96 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000532501 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  96 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0259  tRNA-Ile  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0040  tRNA-Ile  95.92 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241965  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0037  tRNA-Ile  95.92 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1085  tRNA-Ile  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0002  tRNA-Ile  92.98 
 
 
78 bp  81.8  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0015  tRNA-Ile  92.98 
 
 
78 bp  81.8  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.173828  normal  0.314939 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0032  tRNA-Ile  94.34 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0026  tRNA-Ile  94.34 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0036  tRNA-Ile  97.78 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.912426  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>