More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_tIle01 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_tIle01  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0014  tRNA-Ile  97.3 
 
 		 74 bp  131  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0044  tRNA-Ile  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000172197  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0026  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0054  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467793  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0017  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt04  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000322453 
 
 
-
 
NC_002950  PGt31  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt37  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_002950  PGt46  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0035  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115961  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0011  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13662  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148645  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0051  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.484505  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07697  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0007  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0924996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0036  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.432918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0052  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0031  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0026  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0180152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0042  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00111432  normal  0.385328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0007  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00808178  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0015  tRNA-Ile  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000549591  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0028  tRNA-Ile  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000471614  decreased coverage  0.000367782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0043  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0208406  normal  0.220068 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAIleVIMSS1309371  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0037  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0023  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0006  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0033  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0017  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0314309  normal  0.837845 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0050  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0010  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0022  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000102931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0033  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000982153  normal  0.21977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0042  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0028  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0012  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0025  tRNA-Ile  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0051  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0002  tRNA-Ile  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000719363  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0022  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.362568  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAIleVIMSS1309088  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAIleVIMSS1309139  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAIleVIMSS1309203  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.765225  normal  0.83434 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309281  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309289  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAIleVIMSS1309162  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0001  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0012  tRNA-Val  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0012  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0001  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0001  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000056497 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00061  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0509967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00071  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0100739  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0004  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00111877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0077  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000248576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226079  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0213  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000151155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5004  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000283414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5077  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000584569  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0273  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0036281  normal  0.436112 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0016  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0022  tRNA-Ile  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4458  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000985365  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4462  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397855  hitchhiker  0.000732879 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0289  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0256101  normal  0.468385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0278  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00714159  normal  0.415657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0292  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000120643  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4375  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000507491  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4219  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00450756  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4344  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0232585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4315  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0699439  normal  0.201928 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4539  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00250858  hitchhiker  0.00000000000409662 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0006  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0108839  normal  0.0634944 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0273  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124539  normal  0.840677 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5291  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000449228  normal  0.256663 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0090  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000296834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4600  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000666504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3573  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000468269  normal  0.424687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0214  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00923178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0196  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4641  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000032657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0016  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00171399  hitchhiker  0.0041284 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0006  tRNA-Ile  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4268  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00604993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4375  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.120949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0020  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00394718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0092  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00539323  decreased coverage  0.00141538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0103  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00507683  decreased coverage  0.00339417 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0004  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0018  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0046  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0052  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0058  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.605356  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0070  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.187227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0085  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0425046  normal  0.137972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0094  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00126026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>