More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_R0001 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0001  tRNA-Ile  95.52 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0001  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0001  tRNA-Ile  94.29 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0001  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699866 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00170  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0001  tRNA-Ile  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0001  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0001  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0054  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467793  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0001  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14001  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0001  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00090  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0051  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0001  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226648  normal  0.0173253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0001  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484512  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0001  tRNA-Ile  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0001  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.429514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0001  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522467  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0001  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0001  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0004  tRNA-Ile  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0654807  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0001  tRNA-Ile  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0001  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0001  tRNA-Ile  93.62 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0441602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0001  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000056497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00090  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0001  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00090  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609024  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0001  tRNA-Ile  87.14 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.560835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0081  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0037  tRNA-Val  91.38 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00080  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00665402  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0095  tRNA-Ile  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0001  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0001  tRNA-Ile  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.996709  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt06  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt06  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0001  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334662  normal  0.586783 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0010  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 80 bp  60  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 80 bp  60  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 80 bp  60  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 80 bp  60  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 80 bp  60  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 80 bp  60  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 80 bp  60  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 80 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 80 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 80 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0057  tRNA-Val  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385214  hitchhiker  0.00196821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0007  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0924996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0036  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.432918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0052  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0031  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0042  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00111432  normal  0.385328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0007  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00808178  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0048  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00260543  hitchhiker  0.000838943 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0026  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0180152  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0001  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  hitchhiker  0.00194035 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0009  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.389462  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0016  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0001  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412787  normal  0.687718 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000271401  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>