119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_R0010 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_R0016  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0010  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0025  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0002  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000719363  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0024  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00268867  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0568  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0003  tRNA-Ile  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000227262  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0003  tRNA-Ile  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000155812  hitchhiker  0.0000000064789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00170  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0037  tRNA-Ile  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0181  tRNA-Ile  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00212444  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt016  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0660  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.834568  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0005  tRNA-Ile  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125114  hitchhiker  0.00000268461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0027  tRNA-Ile  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0579561  normal  0.867818 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0035  tRNA-Met  85.94 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0095  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1214  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0019  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0049  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.538867  hitchhiker  0.000544539 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0057  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0062  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0020  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0051  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200036 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0059  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0064  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0001  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0001  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0001  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226648  normal  0.0173253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0001  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484512  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0001  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334662  normal  0.586783 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14001  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0001  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  hitchhiker  0.00194035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0025  tRNA-Val  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.19601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0001  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000056497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tIle01  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0001  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531061 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0007  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000510908  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0054  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0435849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0064  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0010  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.885368  normal  0.217926 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0051  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0061  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0004  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0654807  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0015  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0058  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.185628  hitchhiker  0.000282949 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0063  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0253659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0068  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000051508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0073  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0994061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0013  tRNA-Val  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0009  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0789863  normal  0.0348926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0014  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206822  hitchhiker  0.00501521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0031  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0092  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0097  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504203 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0012  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.453389  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0057  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0068  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0048  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.326347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0053  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0001  tRNA-Ile  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0052  tRNA-Ile  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126724  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0057  tRNA-Ile  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0003  tRNA-Ile  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212749  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0056  tRNA-Ile  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00769688  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0043  tRNA-Ile  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.077359  normal  0.13157 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0029  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.856201  normal  0.110623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0058  tRNA-Ile  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00305768  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00080  tRNA-Ile  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226079  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS00235  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00686486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05732  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705135  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_003296  RS05381  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0141064  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0052  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188618  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0062  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0202562  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0071  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00351274  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0079  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0045  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339043  hitchhiker  0.000000161581 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0026  tRNA-Met  84.38 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000000983992  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0053  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0071  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00796346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0076  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0034  tRNA-Met  84.38 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000193112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0022  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0033  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0776982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0053  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00143998  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0063  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000469016  normal  0.343249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0044  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0237492  normal  0.0570511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0054  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000352314  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0006  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0022  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0003  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0017  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000249531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0058  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00795225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0073  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000410343  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0069  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0826408  hitchhiker  0.0022549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0058  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00611811  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>