295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00170 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00170  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00090  tRNA-Ile  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0001  tRNA-Ile  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0001  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0001  tRNA-Ile  90 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0001  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0001  tRNA-Ile  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0001  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0001  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0001  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0048  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00260543  hitchhiker  0.000838943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0001  tRNA-Ile  87.14 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  hitchhiker  0.00194035 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0020  tRNA-Ile  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0001  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412787  normal  0.687718 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0010  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0038  tRNA-Ile  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0001  tRNA-Ile  87.14 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334662  normal  0.586783 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0009  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.389462  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0016  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0001  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0022  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016919  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0001  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.429514  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0031  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.136071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0121  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0058  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00305768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0020  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0179841  hitchhiker  0.00030602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0002  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0001  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0001  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0054  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0110  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436648  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0009  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0001  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522467  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1568  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1603  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.840001 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1800  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.21567e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1806  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000532501 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0081  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0001  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.560835  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0095  tRNA-Ile  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0056  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0042  tRNA-Ile  85.33 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0031  tRNA-Ile  85.33 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0830552 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0001  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484512  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0002  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0099  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0089  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0795  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0001  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14001  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07470  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349913  normal  0.175912 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>