40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0038 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0038  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0020  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0048  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00260543  hitchhiker  0.000838943 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0057  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0020  tRNA-Ile  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0179841  hitchhiker  0.00030602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0022  tRNA-Ile  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016919  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0031  tRNA-Ile  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.136071  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00170  tRNA-Ile  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00090  tRNA-Ile  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.449511  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_892  tRNA-Ile  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0454631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0058  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00305768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0051  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0001  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  hitchhiker  0.00194035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0001  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334662  normal  0.586783 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0040  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0028  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.79359e-16  unclonable  0.0000000519996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0019  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.47791e-17  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0003  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281638  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0037  tRNA-Val  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0260915  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0010  tRNA-Val  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0001  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0441602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0001  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.429514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0026  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0023  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0208908  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt17  tRNA-Met  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt17  tRNA-Met  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0006  tRNA-Met  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0001  tRNA-Ile  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00324355  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0038  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0001  tRNA-Ile  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0085  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0004  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.425707  normal  0.204781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0032  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.216306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0044  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0029  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0021  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>