More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_R0031 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_R0031  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.136071  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.449511  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_892  tRNA-Ile  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0454631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0007  tRNA-Ile  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00808178  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0042  tRNA-Ile  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00111432  normal  0.385328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0007  tRNA-Ile  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0924996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0036  tRNA-Ile  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.432918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0052  tRNA-Ile  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0057  tRNA-Ile  94.23 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309289  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAIleVIMSS1309162  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAIleVIMSS1309088  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309281  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0037  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0006  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0033  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0017  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0314309  normal  0.837845 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0050  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0010  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAIleVIMSS1309203  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.765225  normal  0.83434 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAIleVIMSS1309139  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0020  tRNA-Ile  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0038  tRNA-Ile  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0012  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0022  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.362568  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0042  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0043  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0208406  normal  0.220068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0028  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0022  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000102931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0033  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000982153  normal  0.21977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0023  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0031  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0026  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0180152  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAIleVIMSS1309371  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0015  tRNA-Ile  85.53 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000549591  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0028  tRNA-Ile  85.53 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000471614  decreased coverage  0.000367782 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00090  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00170  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0052  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126724  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0057  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0037  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0181  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00212444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t48  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t70  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619158  hitchhiker  0.00932375 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0004  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0009  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.425741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3075t  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0004  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.147077  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0005  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000179229  normal  0.648072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5402  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0831781  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0014  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192391  hitchhiker  0.00313386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0059  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000552358  normal  0.693628 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0031  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t03  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t09  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0116209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t15  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160114  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t42  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t63  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.07883  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0009  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618734  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0024  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0096  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0060738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4845  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0555625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0022  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000998833  hitchhiker  0.000594977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA14  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0900551  normal  0.0100999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA5  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA51  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000929539  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA73  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA82  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000191187  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0011  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00277001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R13  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000158888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R2  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R42  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000533032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R59  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000380652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R80  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887019  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R93  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000022565  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0002  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000539151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0004  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000076362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0035  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000956793  normal  0.185983 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t03  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0812  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460941  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0002  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0002  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000811561  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0012  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000226616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0056  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00138336  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0078  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000836991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0086  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00068353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0009  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0460221  hitchhiker  0.00205125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0014  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0007  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00099613  hitchhiker  0.000158126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0079  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000309524  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0055  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00629084  normal  0.290237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0098  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000369381  normal  0.163162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0009  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.389462  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08580  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000150356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55635  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.269622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62080  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0500428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>